19 tháng 12 năm 2022

Bộ môn Công nghệ Sinh học - Thực phẩm

Tổng Quan: Viroid là các RNA tròn, tác nhân lây nhiễm có RNA sợi đơn nhỏ phân tử, viroid không mã hóa protein, chiều dài của viroid khoảng 250 đến 400 nuclêôtit. Viroid có thể sao chép và di chuyển qua các cây bị nhiễm bệnh, thường xuyên gây bệnh nặng trên cây trồng đến còi cọc nặng, hoại tử lá, bần thân, cuốn lá và biến dạng quả tùy thuộc vào cây ký chủ và loài viroid.
Chúng chứa năm vùng cấu trúc: vùng cuối bên trái (T1), vùng gây bệnh(P), vùng bảo tồn trung tâm (C), vùng biến đổi (V) và vùng cuối bên phải (T2). Tất cả các loài trong họ Pospiviroidae đều có cấu trúc bậc hai hình que, chứa năm miền cấu trúc/chức năng (Keese 1985) và sao chép trong nhân. Ba trong số bốn thành viên của họ Avsunviroidae có cấu trúc thứ cấp phân nhánh, và tất cả sao chép/tích lũy trong lục lạp. Tất cả các thành viên của Avsunviroidae chứa các ribozyme đầu búa ở cả sợi (+) truyền nhiễm và sợi bổ sung (-) chuỗi RNA. Hình 2-1 so sánh các cấu trúc thứ cấp của PSTVd (dạng que, Pospiviroidae) và viroid khảm tiềm ẩn Peach (PLMVd; phân nhánh, Avsunviroidae).
Nghiên cứu này cho thấy hiệu quả của giao thức multiplex RT-PCR đối với xác định đương đại của hai viroid lây nhiễm trên cây nho. phương pháp là được xác nhận bằng cách thử nghiệm các cây nho bị nhiễm bệnh tự nhiên từ Đại học Da-Yeh của Đài Loan và được chứng minh là nhạy cảm và đáng tin cậy cả khi không có và có mặt cặp mồi được thiết kế để khuếch đại kiểm soát nội bộ có nguồn gốc từ máy chủ.
Mục đích: phát hiện bệnh trên thực vật bằng phương pháp PCR và Real time-PCR (qPCR). Từ đó xem khả năng gây bệnh cho các cá thể trên cây thực vật khác, cụ thể là trên cây nho (Grape)
Đối tượng nghiên cứu: cây nho (Vitis vinifera)
Kết quả đạt được:
Bước đầu đã xác định được bệnh thuộc nhóm truyền nhiễm, khả năng gây nhiễm cao bằng phương pháp PCR, đồng thời phát triển phương pháp PCR thành phương pháp mRT-PCR(multiplex RT-PCR), tăng khả năng phát hiện bệnh nhanh với số lượng nhiều virus hơn.
Tài liệu tham khảo
Thien, N.P. and Y.C. Chen. Simultaneous Detection of Two Viroids Infecting Grapevines in Taiwan by Multiplex RT-PCR. Chiang Mai J. Sci, 2017. 44(3): p. 721-730.
Thien, N.P., Assessment of the Methods for the Detection of Hop Stunt Virus and Yellow Speckle Virus Related Grapevine. 2017
(Vahid Jalali Javaran 2021)
Vahid Jalali Javaran, P. M., Pierre Lemoyne, Dong Xu, Charith Raj Adkar-Purushothama and Mamadou Lamine Fall (2021). "Grapevine Virology in the Third-Generation Sequencing Era: From Virus Detection to Viral Epitranscriptomics." 10(1): 2355.
Kết quả đạt được